Où pêcher en Bourgogne-Franche-Comté

À l'est de la région, la pluie ne ruisselle pas : elle entre dans le calcaire, circule dans le noir pendant des jours, et ressort plus bas par une source qui est déjà une rivière. La Loue, le Lison, le Dessoubre ne commencent pas, ils réapparaissent. À l'ouest, au contraire, l'eau se pose et reste : étangs de Bresse et de Puisaye, biefs de canal, réservoirs de l'Auxois. C'est cette ligne-là, géologique et non administrative, qui découpe vraiment les 5 105 spots de la région. Elle explique aussi pourquoi les départements les plus réputés pour leurs rivières sont ceux qui comptent le moins de points sur une carte.

Mis à jour en septembre 2026 · Par Arthur Fourets

L'eau d'ici passe du temps sous terre

Regardez une carte géologique avant une carte des spots. À l'est, les plateaux du Jura et du Haut-Doubs sont du calcaire fissuré : la pluie n'y ruisselle pas, elle entre. Elle circule dans le noir pendant des jours, parfois des semaines, et ressort plus bas par une source qui est déjà une rivière. La Loue à Ouhans, le Lison, le Dessoubre, le Cusancin ne commencent pas : ils réapparaissent.

La preuve est locale, et c'est un accident. En 1901, la distillerie Pernod de Pontarlier brûle ; pour éviter le pire, on vide les cuves d'absinthe dans le Doubs. Quelques dizaines d'heures plus tard, la source de la Loue, à une quinzaine de kilomètres de là et dans une autre vallée, sent l'absinthe. Le lien était soupçonné ; ce jour-là il est devenu visible. C'est l'un des traçages fondateurs de l'hydrogéologie européenne, et il s'est fait tout seul, dans une vallée à truites.

Au bord de l'eau, ça commande le reste. Une rivière karstique ne répond pas à la pluie que vous avez vue tomber, mais à celle que la roche a stockée et qu'elle relâche à son rythme. Elle peut se troubler en quelques heures après un orage passé vingt kilomètres plus loin, sur un bassin que rien n'indique en surface, puis redevenir claire aussi vite. À l'ouest, l'eau se pose au lieu de circuler : étangs de la Bresse, de la Puisaye et du Charolais, biefs de canal, réservoirs de l'Auxois. Le niveau y bouge en semaines.

La ligne qui structure vraiment la région n'est donc pas la fusion de 2016. La plaine de la Saône court sans rupture de la Haute-Saône à la Saône-et-Loire, la Bresse est à cheval sur le 71 et le 39, et il n'existe aucune frontière halieutique entre « Bourgogne » et « Franche-Comté ». Ce qui change d'ouest en est, c'est ce que le sol fait de la pluie.

Faites glisser le schéma pour l'explorer, ou touchez-le pour l'ouvrir en grand.

Faites glisser le schéma pour l'explorer, ou touchez-le pour l'ouvrir en grand.

Ces cinq milieux sont rangés par ce qui retient l'eau : la roche à l'est, le sol argileux à l'ouest, l'écluse et le barrage partout où l'on a voulu décider du niveau, et la Saône qui finit par tout ramasser. Un même département en tient souvent deux. Le Jura est le seul à les tenir presque tous, avec les étangs de la Bresse jurassienne d'un côté, le karst et les grandes retenues de l'autre.

Un mot sur le vocabulaire, parce qu'il envoie au mauvais poste. Dans le Jura et le Haut-Doubs, le mot « lac » recouvre deux régimes opposés. Vouglans et Coiselet sont des ouvrages de barrage, dont la cote suit la production et l'hydrologie. Chalain, Clairvaux, Narlay, Saint-Point sont des lacs d'origine glaciaire, qui ne marnent pas de la même manière. Même mot, deux façons de lire une berge.

479 spots sur 600 km² : l'anomalie belfortaine

Le Territoire de Belfort pèse 479 spots. Le Doubs, son voisin immédiat, en pèse 255. Le Territoire fait environ 600 km², le Doubs environ 5 200 : à surface égale, le plus petit département français hors Île-de-France est seize fois mieux fourni en points que le département le plus réputé de la région pour ses rivières.

L'explication est dans le sol et dans l'histoire. La trouée de Belfort est le seul passage bas entre les Vosges et le Jura ; les glaciers puis les hommes l'ont remplie d'eau. Étangs de ferme au sud, vers le Sundgau ; ballons, eau vive et froid au nord ; le canal du Rhône au Rhin qui la traverse, et un canal de la Haute-Saône jamais terminé qui s'arrête en chemin. Le tout dans un mouchoir où rien n'est à plus de vingt minutes.

Personne ne prévoit une semaine de pêche dans le Territoire de Belfort. C'est justement pour ça que le chiffre est haut : ce sont des eaux petites, proches, communales, chacune avec un nom, un accès et une AAPPMA derrière. Une eau réputée attire des pêcheurs ; une eau domestique produit des fiches.

Du 1 104 au 255 : ce que le compteur sait nommer

Huit départements, du simple au quadruple, et l'écart raconte surtout deux façons d'avoir de l'eau.

Faites glisser le schéma pour l'explorer, ou touchez-le pour l'ouvrir en grand.

La source de la Loue est un point sur toutes les cartes. L'eau qui en sort vient du Doubs, une quinzaine de kilomètres plus haut, par des galeries que personne n'a jamais levées. Un recensement a exactement le problème de l'hydrogéologue : il sait nommer les endroits où l'eau apparaît, pas les trajets qu'elle fait.

D'où le haut du tableau. La Saône-et-Loire (1 104), la Côte-d'Or (921), la Haute-Saône (674) et l'Yonne (611) sont des pays de plans d'eau : chaque étang a un bord, un propriétaire et une adresse, donc une entrée possible. D'où le bas, aussi : le Doubs (255) est le département le plus « rivière » de la région. Sa page ne relève que six fiches à truite : un chiffre qui décrit l'état du recensement, pas celui de la rivière.

Le Jura (567) est le seul à tenir les deux registres, étangs de la Bresse jurassienne d'un côté, karst et grandes retenues de l'autre. Pour le reste, ce classement dit où l'eau porte un nom et un accès. Il ne dit rien de ce qu'on y prend.

Les 8 guides départementaux

Huit départements et deux façons de tenir l'eau. Chaque page détaille les milieux dominants, les espèces et les accès du département.

• Saône-et-Loire 71 1 104
• Côte-d'Or 21 921
• Haute-Saône 70 674
• Yonne 89 611
• Jura 39 567
• Nièvre 58 494
• Territoire de Belfort 90 479
• Doubs 25 255

Les quatre premiers du tableau sont des pays de plans d'eau, les deux derniers des pays de rivières. Ce n'est ni le même week-end, ni la même façon de le préparer : d'un côté on choisit un point d'eau, de l'autre on choisit un parcours.

Les 6 pays de la région

Un département est un découpage de préfecture ; un pays est une unité de paysage, et c'est le nom que les pêcheurs emploient réellement entre eux. Ces secteurs-là ignorent les frontières qu'on vient de lister : certains tiennent dans un coin de département, d'autres se partagent entre trois.

• La Bresse 872
• La Puisaye 332
• Le Morvan 321
• Le Plateau des Mille Étangs 145
• Le Haut-Doubs 88
• Le Haut-Jura 28

Les guides par ville

Ces rayons font 30 km et ne s'arrêtent pas aux frontières : c'est pourquoi Mulhouse (Haut-Rhin) et Roanne (Loire) figurent dans la liste, et pourquoi le rayon de Belfort mord largement sur le Sundgau alsacien. Les rayons se chevauchent entre eux, leur somme n'a donc aucun sens, et un rayon de ville ne se compare pas à un département.

• Belfort 968
• Mulhouse 528
• Lons-le-Saunier 524
• Chalon-sur-Saône 502
• Dole 442
• Dijon 330
• Mâcon 298
• Vesoul 291
• Nevers 236
• Auxerre 220
• Roanne 188
• Besançon 152

Ces nombres ne s'additionnent pas : les rayons se recouvrent et débordent sur les départements voisins.

Choisir selon ce que vous cherchez

De l'eau claire et de la pêche à vue : les vallées karstiques du Doubs (25) et du Jura (39). La Loue, le Lison, le Dessoubre et le Cusancin sortent d'une roche qui filtre : la visibilité y est sans rapport avec celle des rivières de plaine bourguignonnes, et la température bouge peu à la source. En échange, tout se joue vite : une averse tombée sur un plateau que vous ne voyez pas peut troubler la rivière en quelques heures et la rendre à sa couleur aussi vite. Venez avec la carte des parcours de la fédération plutôt qu'avec une liste de points : c'est aussi le secteur où le recensement est le plus pauvre. Plusieurs tronçons sont en parcours particuliers ou en no-kill, et ces règles évoluent.

De la grande eau à carnassiers, du bord et sans bateau : La Saône, de Gray (70) à Mâcon (71). Environ trois cents kilomètres de rive continue, un niveau tenu pour la navigation donc rarement injouable, et des confluences, le Doubs, l'Ouche, la Seille, la Grosne, qui concentrent le poisson à des endroits repérables sur une carte. C'est le seul milieu de la région qui se pêche de la même façon sur trois départements : vous changez de page départementale sans changer de technique. Le silure est installé sur la partie aval, le sandre et le brochet sont partout.

Enchaîner cinq eaux différentes dans un week-end : Le Territoire de Belfort (90) et le plateau des Mille Étangs (70). C'est la plus forte densité de la région : 479 spots tiennent dans les 600 km² du Territoire, et tout y est à moins de vingt minutes. Deux bases possibles pour un séjour où l'on teste plusieurs eaux sans passer la journée en voiture. Attention au nom : « plateau des Mille Étangs » est un nom de pays, pas un inventaire, et une grande partie de ces étangs sont privés — ils se demandent au propriétaire ou passent par l'AAPPMA locale.

Une sortie simple, avec un enfant ou un débutant — Les canaux : Bourgogne (21/89), Nivernais (58/89), Centre (71). Niveau constant, pas de crue, chemin de halage praticable sur des centaines de kilomètres, écluses et ponts qui font des postes évidents et lisibles même sans expérience. C'est aussi le seul milieu de la région qui reste pêchable quand les rivières débordent et que les étangs sont pris : sauf pendant les chômages, quand un bief peut être abaissé ou mis à sec. Ce n'est pas un repli au rabais : dans cette région, le réseau de canaux est un milieu à part entière, avec ses populations et ses habitués.

Du volume d'eau, un sondeur ou un float tube : Vouglans (39) ou les lacs du Morvan (58). Les deux grands ensembles de retenues de la région, à ses deux extrémités, avec des mécaniques de marnage différentes : Vouglans suit la production hydroélectrique, les lacs du Morvan servent aussi à la gestion des débits en aval. Le critère qui tranche est autant administratif que technique. Vouglans est dans le seul département de la région hors réciprocité, le Morvan non. Dans les deux cas, vérifiez la cote du jour avant de prévoir une mise à l'eau.

Réciprocité, frontière suisse, cotes et chômages

Le Jura est l'exception de la région. Sept départements sur huit fonctionnent normalement avec les ententes réciprocitaires ; le Jura (39), lui, est hors entente : ni carte interfédérale ni timbre réciprocitaire n'ouvrent les lots gérés par ses AAPPMA. Vouglans, Chalain, Clairvaux, l'Ain, la Bienne demandent une carte du Jura. C'est le piège du pêcheur qui monte de Côte-d'Or ou de Saône-et-Loire pour la journée et qui l'apprend au parking. Vérifiez l'entente du département visé au moment d'acheter votre carte, sur le site de la fédération concernée.

Le Doubs frontalier a son propre règlement. Sur le tronçon où la rivière fait la frontière, secteur de Villers-le-Lac, lac de Chaillexon, Saut du Doubs, jusqu'aux environs de Goumois,, les règles ne sont pas celles du reste du département : périodes, engins, hameçons et mesures de protection y sont fixés par un texte franco-suisse propre, et la rive suisse suppose une autorisation cantonale séparée. Lisez l'arrêté en cours et le règlement de l'AAPPMA locale, pas la réglementation départementale générale.

Les rivières karstiques se préparent auprès de la fédération. Sur la Loue, le Dessoubre, le Lison et leurs affluents, des parcours particuliers, des secteurs en no-kill et des mesures de protection s'appliquent selon les tronçons, et ils changent. L'ombre en particulier n'est pas pêchable partout de la même façon. Ces rivières ont par ailleurs connu des épisodes documentés de mortalités et de proliférations d'algues, et leur état varie d'un tronçon et d'une année à l'autre : la fédération départementale est la seule source à jour, avant de partir comme au bord de l'eau.

Cotes de retenues et chômages de canaux. Trois familles d'ouvrages, trois calendriers de baisse : Vouglans est une retenue hydroélectrique dont la cote suit la production, les lacs du Morvan (Settons, Pannecière, Chaumeçon, Crescent) servent aussi à la gestion des débits en aval, et les réservoirs de l'Auxois (Grosbois, Panthier, Chazilly, Cercey) sont conçus pour être puisés au fil de la saison de navigation du canal de Bourgogne. La rampe de mise à l'eau vue en photo peut se retrouver loin de l'eau. Côté canaux, VNF programme chaque année des arrêts de navigation pendant lesquels des biefs peuvent être abaissés ou mis à sec : un bief en chômage ne supprime pas le droit de pêche, il transforme le plan d'eau. Consultez le calendrier des chômages avant de caler un séjour canal.

Questions fréquentes

À lire ensuite

Où pêcher en France · Saône-et-Loire (71) · Côte-d'Or (21) · Près de Belfort · Faut-il une carte de pêche ?